El artículo del Times señaló que Gilliam todavía tenía algunos problemas notables al realizar “12 Monkeys”. Los animatrónicos futuristas de Gilliam seguían estropeándose, por ejemplo. También quería rodar una escena nevada en Baltimore, pero hacía demasiado calor. Gilliam también tuvo que volver a filmar ciertas escenas para mantener la continuidad; Mantener la continuidad entre secuencias futuras y secuencias presentes ha confundido a muchos cineastas. A pesar de todo, Gilliam entregó la película una semana antes y por debajo del presupuesto. Al parecer todavía se estaba recuperando de la producción de 1988 de “Baron Munchausen”, que inicialmente tenía un presupuesto de 23,5 millones de dólares, pero que finalmente se disparó a 46,5 millones de dólares. Además de eso, la película sólo recaudó 8 millones de dólares.
Gilliam se recuperó bien en 1991 con “El Rey Pescador” es emocionalmente desarmante, Pero los malos recuerdos de Munchausen lo perseguían.
Gilliam parece haber tenido un mecanismo para afrontar la presión que enfrentó en 12 Monkeys. Le encantaba montar a caballo lejos del grupo. Desafortunadamente, esto también se convirtió en una fuente de tensión, ya que su caballo lo arrojó del lomo y casi lo pisotea. Gilliam resultó ileso, pero su orgullo debe haber sido herido al recibir estrés de aquello de lo que se suponía que debía curarlo.
“12 Monkeys” finalmente fue nominada a dos premios de la Academia, incluido el de Mejor Actor de Reparto (Brad Pitt) y Mejor Vestuario. También fue un gran éxito, recaudando 168 millones de dólares en todo el mundo. En 2015, Terry Matalas adaptó la película de Gilliam a una serie de televisión de gran prestigio. Gilliam casi fue pisoteado, pero al final estuvo bien. Por una vez, parecía que había hecho una película sin la habitual ola de mala suerte.